Spillet er udviklet i et hemmeligt laboratorium placeret på bunden af ​​havet. Her i ensomhed boede en excentrisk videnskabsmand, erfaringer og eksperimenter kollegaer bebrejde ham. Hans vigtigste opgave var at skabe et levende væsen udstyret med fornuft og år senere gjorde han det. Men samtidig skaberen forsvandt under mystiske omstændigheder, efterlod Goo (dette navn har fået sit afkom) og vente for ham at gå glip af. Hero træt af at hænge ud i en kolbe-kamera og komme ud af det, gik han på en rundtur i den komplekse at finde spor af den forsvundne ven. Evnen til at vælge den grad af elasticitet vil bidrage til at overvinde forskellige forhindringer, for at klare fjenden og at trænge ind til, hvor den almindelige mand eller hvordan ikke at få.